دکتر مصطفی آگاه پس از فارغ التحصیلی در رشته تخصصی جراحی عمومی دانشگاه شهید بهشتی، مدارج تحصیلی را در مقطع تخصصی جراحی پلاستیک‌ و زیبایی در اتریش و فلوشیپ لیزر را در تهران به پایان رساندند.